植物实时荧光定量PCR内参基因的选择

›› 2009, Vol. 11 ›› Issue (6): 30-36.

植物实时荧光定量PCR内参基因的选择

胡瑞波,范成明,傅永福

(国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程, 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081)

收稿日期:2009-03-25 修回日期:2009-10-28 出版日期:2009-12-15 发布日期:2009-11-20
通讯作者: 傅永福,研究员,主要研究方向为植物发育分子生物学。Tel:010-82105867;E-mail:fufu19cn@163.com
作者简介:胡瑞波,博士研究生,研究方向为植物发育分子生物学。E-mail: rayhu@yahoo.cn
基金资助:
国家863计划项目(2006AA10A111,2007AA10Z119);国家转基因重大专项(2008ZX0809-001);“十一五”国家科技支撑计划项目(2007BAD59B02)资助。

Reference Gene Selection in Plant Real-time Quantitative Reverse Transcription PCR (qRT-PCR)

HU Rui-bo, FAN Cheng-ming, FU Yong-fu

(Institute of Crop Science, National Key Facility of Crop Gene Resource and Genetic Improvement, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China)

Received:2009-03-25 Revised:2009-10-28 Online:2009-12-15 Published:2009-11-20

摘要/Abstract

摘要：

实时荧光定量RT-PCR(real-time quantitative reverse transcription PCR, qRT-PCR)具有定量准确、灵敏度高和高通量等特点,已被广泛应用于基因的表达分析。常规qRT-PCR采用相对定量进行分析,其关键步骤是选择合适的稳定内参基因进行校正和标准化。持家基因被广泛用作内参基因,但在所有生理条件下均稳定表达的理想内参基因并不存在。大多数传统内参基因已不能满足qRT-PCR准确定量的要求。基于基因芯片表达数据和EST数据库并结合qRT-PCR,可以筛选稳定性好的新的内参基因。简要综述了植物qRT-PCR内参基因的研究进展,并就内参基因的选择中应注意的问题进行了探讨。

关键词: 实时荧光定量RT-PCR, 内参基因, geNorm, 基因表达

Abstract:

Real-time quantitative RT-PCR (qRT-PCR) technology, with quantitative accuracy, high sensitivity and high-throughput characteristics, has been widely used in gene expression analysis. Based on the relative quantitative analysis, qRT-PCR data must be normalized with one or more proper and stable internal reference genes. House-keeping genes are customarily used as endogenous references for relative quantification. But not a single gene can act as a universal reference reported so far. Most of the traditional housekeeping genes are unable to ensure accurate normalization in qRT-PCR. Based on the tremendous gene-chip expression data and public deposited EST data, new reference genes with superior stability were selected and verified with qRT-PCR. The research progress of reference genes in plant qRT-PCR was reviewed and aspects to be considered in future reference gene selection were also discussed.

Key words: real-time quantitative reverse transcription PCR, reference genes, geNorm, gene expression

中图分类号:

Q789

胡瑞波,范成明,傅永福. 植物实时荧光定量PCR内参基因的选择[J]. , 2009, 11(6): 30-36.

HU Rui-bo, FAN Cheng-ming, FU Yong-fu. Reference Gene Selection in Plant Real-time Quantitative Reverse Transcription PCR (qRT-PCR)[J]. , 2009, 11(6): 30-36.

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