高粱GRF基因家族鉴定及在非生物胁迫下的表达分析

doi:10.13304/j.nykjdb.2020.0278

中国农业科技导报 ›› 2021, Vol. 23 ›› Issue (4): 37-46.DOI: 10.13304/j.nykjdb.2020.0278

高粱GRF基因家族鉴定及在非生物胁迫下的表达分析

崔江慧§,杨溥原§,常金华*

河北农业大学农学院，河北保定 071001

收稿日期:2020-04-01 出版日期:2021-04-15 发布日期:2020-07-21
通讯作者: 常金华 E-mail：jhchang2006@126.com
作者简介:§崔江慧与杨溥原为本文共同第一作者。崔江慧 E-mail：cjianghui521@126.com；杨溥原 E-mail：yangpuyuan520@163.com
基金资助:
河北省重点研发计划项目（19226370D）

Identification and Expression Analysis Under Abiotic Stress of GRF Gene Family in Sorghum

CUI Jianghui§, YANG Puyuan§, CHANG Jinhua*

College of Agronomy, Hebei Agricultural University, Hebei Baoding 071001, China

Received:2020-04-01 Online:2021-04-15 Published:2020-07-21

摘要/Abstract

摘要： 生长调控因子（growth regulation factor，GRF）是植物中特有的一类转录因子，在植物激素调控、生长发育以及胁迫应答等多个领域扮演重要角色。对高粱GRF基因家族成员进行筛选鉴定，得到8个家族基因，分析了这些基因的理化性质、保守蛋白序列、基因功能及其共线性，分析了这些基因在非生物胁迫下转录组表达差异。结果表明，GRF基因家族结构较为保守，启动子元件含有干旱、低温、茉莉酸等响应元件，推测该家族基因参与生物及非生物胁迫应答响应。通过盐胁迫和烯效唑处理下的转录组数据分析，得到一个与耐盐相关的基因（SORBI_3002G297800）和一个与激素相关的基因（SORBI_3006G203400），为进一步探究这些基因在高粱应对非生物胁迫中的作用提供了重要参考。

关键词: 高粱, GRF, 鉴定, 表达分析, 非生物胁迫

Abstract: Growth regulation factor (GRF) is a type of special transcription factor in plants, which plays an important role in plant hormone regulation, growth and development, stress response. This paper screened and identified the GRF gene family members of sorghum, obtained 8 GRF genes, and then analyzed their conservative protein domain and gene structure, function promoter elements, evolutionary relationship and collinearity. The results showed 8 GRF genes were conserved in structure in sorghum. The analysis of function promoter elements revealed these genes had drought, low temperature and jasmonate response elements etc, indicating these genes participate in the response to biotic and abiotic stress. A candidate gene (SORBI_3002G297800) for salt tolerance and a gene (SORBI_3006G203400) for hormone stress were screened through transcriptome expression analysis of salt stress and uniconazole treatment. The results provided important reference for further studing the function of these genes in sorghum.

Key words: sorghum, GRF, authenticate, expression analysis, abiotic stress

崔江慧§,杨溥原§,常金华*. 高粱GRF基因家族鉴定及在非生物胁迫下的表达分析[J]. 中国农业科技导报, 2021, 23(4): 37-46.

CUI Jianghui§, YANG Puyuan§, CHANG Jinhua*. Identification and Expression Analysis Under Abiotic Stress of GRF Gene Family in Sorghum[J]. Journal of Agricultural Science and Technology, 2021, 23(4): 37-46.

[1]	邝凡, 肖明昆, 黄钰涵, 江洪敏, 胡磊, 魏英, 胡威. 柠檬草精油的提取、成分鉴定及对红火蚁的熏蒸活性研究[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(9): 155-164.
[2]	李海燕, 张婷, 李新畅, 张玲, 王培, 鲍民胡. 一株拮抗葡萄灰霉病菌的贝莱斯芽孢杆菌筛选及鉴定[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(8): 110-118.
[3]	胡懿, 公杰, 赵玮, 程蓉, 柳忠玉, 高世庆, 杨亚珍. 小麦PHY基因家族鉴定及热胁迫下表达分析[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(7): 30-43.
[4]	王满红, 肖梅娟, IRSHAD Ahmad, NIMIR Eltyb Ahmed Nimir, HANADI Ibrahim El Dessougi, 周桂生, 朱广龙. 高粱苗期耐盐性鉴定与评价[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(6): 52-63.
[5]	梁丽存, 于会民, 管晓晨, 黄火清, 姚斌, 杨浩萌. 塔宾曲霉的鉴定及基因编辑方法对其同源重组效率的影响[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(6): 83-92.
[6]	陈宜新, 杨秀波, 田士军, 王聪, 白志英, 李存东, 张科. 陆地棉GhCOMT28对干旱胁迫的响应[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(4): 45-56.
[7]	刘金仙, 王丽娟, 刘杰, 傅仙玉, 武广珩. 茶树钙调蛋白结合转录激活因子（CAMTA）家族基因鉴定与表达分析[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(3): 71-82.
[8]	马婷婷, 赵延蓉, 魏玉清, 王悦娟, 王雪飞, 张二东. 土壤盐分胁迫下甜高粱生育后期茎秆生长及其糖分积累的动态变化特征[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(2): 42-50.
[9]	刘锦霖, 陈莹莹, 蓝晓妹, 陈海永, 李鹏声, 覃碧, 杨叶. 哈斯油梨果实炭疽病病原鉴定及杀菌剂敏感性测定[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(1): 138-146.
[10]	季梦婷, 朱玲, 罗晓华, 郑钰婷, 肖顺, 胡方平, 蔡学清. 福建无花果细菌性叶斑病的症状及病原菌鉴定[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(1): 147-154.
[11]	李贤国, 戴麒, 王泽鹏, 陈兆龙, 闫会转, 李宁. 番茄CCCH类锌指蛋白家族的鉴定及其表达分析[J]. 中国农业科技导报, 2025, 27(1): 80-95.
[12]	母时风, 温晓蕾, 冯丽娜, 赵德轩, 高素红, 高朋, 齐慧霞. 一种引起板栗内腐病的果生炭疽菌鉴定及其生物学特性[J]. 中国农业科技导报, 2024, 26(9): 122-128.
[13]	张秀全, 冯晚平, 王嘉伟, 宋海燕, 郑德聪. 揉搓式高粱脱粒装置的设计与性能试验[J]. 中国农业科技导报, 2024, 26(8): 112-121.
[14]	张福林, 奚瑞, 刘宇翔, 陈兆龙, 余庆辉, 李宁. 番茄BURP结构域基因家族全基因组鉴定及表达分析[J]. 中国农业科技导报, 2024, 26(8): 51-62.
[15]	鲍新跃, 陈红敏, 王伟伟, 唐益苗, 房兆峰, 马锦绣, 汪德州, 左静红, 姚占军. 小麦TaCOBL-5基因克隆及表达分析[J]. 中国农业科技导报, 2024, 26(6): 11-21.

高粱GRF基因家族鉴定及在非生物胁迫下的表达分析

Identification and Expression Analysis Under Abiotic Stress of GRF Gene Family in Sorghum

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